氮肥的损失有多种途径，但除氮的挥发损失外，都是通过硝化作用产生的，因此，提高氮肥利用率，主要是以防止铵的硝化为主。
（1）深层施肥。把铵态氮肥或尿素深施到3-5厘米深的还原层中，铵离子为土壤胶体吸附，保持在还原层中避免肥料在氧化层进行硝化作用，以提高氮的利用率。深层施肥可分成球肥深施、全层深施和液肥深施。
（2）氮肥增效剂。又称硝化抑制剂，即使用化学制剂来抑制稻田土壤微生物的反硝化作用，以减少脱氮的损失。目前我国的主要氮肥增效剂有西吡、吡啶等
（3）长效氮肥。长效氮肥主要有三种：一是有机合成氮肥，如尿素甲醛肥料；二是包模肥料，如硫衣包模素；三是长效性无机氮肥，如硫酸镁铵。长效氮肥的目的主要为了防止可溶性氮肥的流失，使氮素的供应尽可能与水稻生长过程中的氮素吸收相吻合，以提高氮肥利用率，同时避免大量氮肥集中施用引起烧苗。